公司型股权投资基金进行基金清算时，公司财产按照以下的顺序分配：1.支付清算费用;2.支付职工的工资、社会保险费用和法定补偿金;3.缴纳所欠税款;4.清偿公司债务;5.剩余的财产有限责任公司按照股东的出资比例分配，股份有限公司按照股东持有的股份比例分配。